尿不干净有余尿可能是由前列腺肥大、膀胱功能障碍和尿道梗阻等原因引起的，一般采用药物治疗、物理治疗和手术治疗来改善，详情如下：

1. 前列腺肥大：前列腺肥大是老年男性常见的疾病，会导致尿道受压，尿流受阻，引起余尿。治疗方法包括药物治疗和手术治疗。药物治疗主要使用α1-肾上腺素受体阻滞剂，如盖非特和特拉唑嗪等，可以缓解尿道症状和改善尿流。手术治疗常采用经尿道腺体电切术、经尿道腺体汽化术等，可以缓解尿流受阻，改善尿道通畅。

2. 膀胱功能障碍：膀胱功能障碍是指膀胱的收缩和放松功能异常，导致尿液排空不完全。常见的疾病包括膀胱麻痹、神经源性膀胱和膀胱颈梗阻等。治疗方法主要包括物理治疗和药物治疗。物理治疗常采用膀胱底电刺激、膀胱按摩等方法刺激膀胱收缩，促进尿液排出。药物治疗主要使用抗胆碱药物，如奥托品和托吡酯等，可以增加膀胱收缩力，改善尿液排空。

3. 尿道梗阻：尿道梗阻是指尿液在尿道内流动受阻，导致尿液排空不畅。常见的原因包括尿道狭窄、结石和尿道肿瘤等。治疗方法主要包括药物治疗和手术治疗。药物治疗常使用抗炎药物和尿道扩张剂，可以缓解尿道狭窄和降低尿道肿瘤的压迫。手术治疗根据具体情况选择尿道扩张术、尿道切开术或尿道重建术等，可以恢复尿液的正常排出。

除以上相对常见原因及治疗方式外，尿不干净有余尿的其他原因还包括膀胱颈部松弛、尿道括约肌功能障碍等。治疗方法可以根据具体病因进行选择，常见的包括膀胱颈支撑器的使用、生物反馈治疗和尿道括约肌训练等。