脚后跟两侧疼痛一般可采用保护休息、物理治疗和药物治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 保护休息：当脚后跟两侧疼痛时，首先需要给予足够的休息，避免过度使用脚部，尤其是长时间站立和走路。此外，可以尝试使用鞋垫或鞋垫来减轻对脚后跟的压力。保护休息适用于脚后跟两侧疼痛轻微、短期的情况。

2. 物理治疗：物理治疗包括按摩、热敷、冷敷和理疗等方法。按摩可以促进血液循环，缓解疼痛和肌肉紧张。热敷可以放松肌肉，增加血液流动，减轻疼痛。冷敷可以减少炎症和肿胀，缓解疼痛。理疗可以通过物理手段改善病变组织的状态，促进康复。物理治疗适用于脚后跟两侧疼痛由肌肉疲劳、炎症或软组织损伤引起的情况。

3. 药物治疗：药物治疗可以采用非处方药或处方药。非处方药包括止痛药和抗炎药，可以缓解疼痛和减轻炎症反应。处方药包括肌肉松弛剂和镇痛药，适用于严重疼痛和肌肉紧张的情况。药物治疗适用于脚后跟两侧疼痛严重、持续时间较长或伴随炎症的情况。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如物理疗法、针灸和手术等。物理疗法可以通过运动、牵引或电疗等方式来改善脚后跟的症状。针灸可以刺激特定穴位，调节气血循环，缓解疼痛和炎症。手术通常用于严重且无法通过其他治疗方式缓解的脚后跟疼痛病症，如跟腱炎、跟骨骨刺等。具体的治疗方式应根据病情和医生建议进行选择。