肩软组织损伤一般是由创伤、运动过度等原因引起的，可采用物理疗法、药物治疗和手术等方式进行治疗，详情如下：

1. 物理疗法：适用于肩软组织损伤程度较轻的患者，如肩袖损伤、肌腱炎等。物理疗法包括热敷、冷敷、按摩、理疗等。热敷适用于缓解肩部疼痛和松弛肌肉，冷敷则适用于减轻肩部肿胀和炎症。按摩和理疗可以促进血液循环，缓解肌肉紧张和疼痛。物理疗法一般适用于早期损伤和轻度症状的患者。

2. 药物治疗：适用于肩关节炎、滑囊炎等炎症相关的肩软组织损伤。常用的药物包括非甾体类抗炎药（如布洛芬）、局部激素注射和关节内注射液等。非甾体类抗炎药可以缓解疼痛和减轻炎症反应，局部激素注射和关节内注射液则可以直接作用于受损区域，减轻炎症和肿胀。药物治疗一般适用于炎症明显或疼痛剧烈的患者。

3. 手术治疗：适用于严重的肩软组织损伤，如肩袖撕裂、肩关节脱位等。手术治疗包括肩关节镜手术、开放手术等。肩关节镜手术是通过微创技术进行，可以修复和重建受损的肩软组织，恢复肩关节的功能。开放手术则适用于复杂的损伤或无法通过肩关节镜手术修复的情况。手术治疗一般适用于严重症状无法缓解或功能受限的患者。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如理疗、针灸、中药疗法等。理疗可以通过运动、牵拉等手段恢复肩关节的功能。针灸和中药疗法可以通过调节气血、舒筋活络等方式促进肩软组织的修复和康复。这些治疗方式适用于对药物或手术治疗有禁忌或不适合的患者。