脑炎后遗症一般是由病毒感染、免疫反应异常等原因引起的，可采用药物治疗、康复训练和手术治疗等方式进行治疗，详情如下：

1.药物治疗：药物治疗是脑炎后遗症治疗的重要手段之一。根据病情严重程度和症状表现，可以选择使用抗病毒药物、抗炎药物和免疫调节药物等。抗病毒药物一般适用于脑炎后遗症由病毒感染引起的患者，可以有效抑制病毒复制和减轻症状。抗炎药物可以减轻脑炎后遗症的炎症反应，缓解症状。免疫调节药物可以调节免疫系统功能，减少自身免疫反应对脑神经组织的损伤。

2.康复训练：康复训练是脑炎后遗症治疗的重要手段之一。根据患者的症状和功能障碍，可以进行物理康复、言语康复和认知康复等。物理康复包括运动训练、物理疗法和功能训练等，可以帮助患者恢复肌肉力量和日常生活能力。言语康复包括语言训练和发音训练等，可以帮助患者改善语言障碍。认知康复包括认知训练和记忆训练等，可以帮助患者恢复认知功能和记忆能力。

3.手术治疗：手术治疗在某些情况下可以是脑炎后遗症的有效治疗方法。例如，对于脑炎后遗症引起的颅内压增高、脑积水或脑疝等情况，可以考虑进行手术治疗。手术可以通过减压手术、脑室分流术或脑疝处理等方式，减轻脑组织的受压情况，改善患者的症状和生活质量。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如物理疗法、中医药治疗、心理辅导等，适用于不同类型的脑炎后遗症患者。在确定治疗方案时，应根据患者的具体情况和病情进行个体化的治疗选择和综合治疗。