两只眼睛不一样一般是由视力不平衡、眼球形状不对称等原因引起的，可采用眼镜矫正、角膜塑形术以及视觉训练等方式进行治疗，详情如下：

1. 眼镜矫正：当两只眼睛度数不一致或者屈光不正时，可以通过佩戴适合的眼镜来矫正视力差异。眼镜矫正适用于度数不大、近视或远视不严重的情况下，能够快速有效地改善视力差异。

2. 角膜塑形术：对于角膜形状不对称引起的视力不平衡，可以考虑进行角膜塑形术。角膜塑形术通过使用特定的角膜接触镜，改变角膜曲率，从而达到矫正视力差异的目的。角膜塑形术适用于度数较大、近视或远视较严重的情况下，需要进行专业医生评估和操作。

3. 视觉训练：对于由眼肌功能不协调引起的视力不平衡，可以通过进行视觉训练来改善。视觉训练包括眼球运动训练、眼肌协调训练等，通过锻炼眼部肌肉和提高眼球运动协调性，从而改善两只眼睛的视力差异。视觉训练适用于眼肌功能不协调、眼球运动不灵活等情况下，需要在专业医生指导下进行。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如手术矫正。手术矫正适用于度数较大、近视或远视较严重，并且经过专业医生评估认为手术是最合适的治疗方法时，可以考虑进行手术矫正。手术矫正可以通过激光手术等方式改变眼球形状，从而达到矫正视力差异的效果。需要注意的是，手术矫正是一种较为复杂的治疗方式，需要在专业医生指导下进行。