新生儿头上有胎记一般是由先天性因素、遗传因素等引起的，可采用药物治疗、激光治疗以及手术治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 药物治疗：对于一些浅表性的胎记，如色素性胎记，可以通过使用药物来辅助治疗。这些药物通常是外用药物，如局部激素类药物，能够抑制色素生成，减轻胎记的颜色和大小。药物治疗通常适用于轻度胎记，且在婴儿的头皮上使用更为安全。

2. 激光治疗：对于一些较深的血管性胎记，如血管瘤，激光治疗是一种常见的方法。激光治疗通过向胎记部位发射高能量光束，破坏异常血管，促使胎记变浅或消失。激光治疗通常适用于血管性胎记，但需要注意选择合适的激光类型和参数，以避免对婴儿的皮肤造成伤害。

3. 手术治疗：对于一些较大、深层的胎记，如巨大痣、脂肪瘤等，手术治疗可能是最有效的方式。手术治疗可以通过切除胎记组织来达到去除胎记的目的。手术治疗适用于那些无法通过其他非侵入性方法治疗的胎记，但需要注意手术风险和术后护理。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如激光和药物联合治疗、冷冻治疗等。激光和药物联合治疗适用于一些较深层的血管性胎记，能够提高治疗效果。冷冻治疗适用于一些浅表性的胎记，通过低温冷冻来破坏胎记组织。选择适合的治疗方式需要根据胎记的类型、大小和深度等因素来确定，同时需结合医生的建议进行决策。