肠道功能性紊乱长期腹泻一般可采用药物治疗、饮食调整以及心理治疗等方式进行治疗，详情如下：

1. 药物治疗：在具体病情分析后，可使用抗生素、抗菌药物、止泻药物等进行治疗。抗生素可用于控制肠道细菌感染，抗菌药物可用于抑制肠道异常菌群的生长，止泻药物可用于减少肠道蠕动，缓解腹泻症状。药物治疗适用于病情较为严重，且有明确病因的情况。

2. 饮食调整：通过调整饮食结构和食物选择，可以帮助减轻肠道功能性紊乱长期腹泻的症状。例如，增加膳食纤维摄入可促进肠蠕动，缓解腹泻；避免摄入过多的刺激性食物，如辛辣食物、油腻食物和咖啡因等，可减少肠道刺激，从而改善腹泻情况。饮食调整适用于病情较轻，没有明确病因的情况。

3. 心理治疗：肠道功能性紊乱长期腹泻与心理因素密切相关，因此心理治疗在治疗过程中起到重要作用。心理治疗包括认知行为疗法、心理咨询等，可以帮助患者减轻压力、调整心态，从而改善肠道功能，减少腹泻发作。心理治疗适用于有明显心理压力的患者。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如中药治疗、针灸治疗等，适用于一些患者。中药治疗可通过草药的调配和中药汤剂的服用来改善肠道功能，缓解腹泻症状；针灸治疗通过刺激特定穴位，调节肠道功能，减少腹泻发作。这些治疗方式一般适用于对药物治疗不敏感或不愿意长期使用药物的患者。