新生儿肠道细菌感染一般是由细菌感染、免疫力低下等原因引起的，可采用药物治疗、营养支持等方式进行治疗，详情如下：

1. 药物治疗：对于新生儿肠道细菌感染，常用的药物治疗方式包括抗生素治疗、抗真菌药物治疗等。抗生素治疗主要针对感染细菌，通过杀灭或抑制细菌的生长来达到治疗目的。抗真菌药物治疗则主要用于对抗真菌感染。在选择药物时，需根据具体情况确定适用的抗生素或抗真菌药物，并严格按照医生的指导进行用药。

2. 营养支持：新生儿肠道细菌感染可能导致消化道功能紊乱，影响营养吸收。因此，通过提供适当的营养支持，有助于维持新生儿正常的生长发育和免疫功能。营养支持方式包括母乳喂养、人工喂养或者特殊配方奶粉喂养等。具体的喂养方式需根据患儿的情况和医生的建议来确定。

3. 支持性治疗：在治疗新生儿肠道细菌感染的过程中，还需要进行一些支持性治疗措施。例如，维持水电解质平衡、保持患儿通气道通畅、监测体温等。这些措施有助于减轻症状，促进患儿康复。

除以上相对常见的治疗方式外，还有其他的治疗方式，比如免疫调节治疗，适用于免疫力低下引起的感染。此外，新生儿肠道细菌感染的治疗还需要综合考虑患儿的具体情况和病原菌的敏感性，以制定个体化的治疗方案。因此，在治疗过程中，需密切关注患儿的病情变化，并及时与医生沟通，以便进行及时调整和干预。